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Blog de Ibercivis

Nueva aplicación beta: Protomol

A todos aquellos que hayan marcado la casilla de probar aplicaciones beta, hoy estrenamos la beta de la aplicación de un nuevo proyecto de investigación en Ibercivis. De momento no puedo dar muchos detalles porque aun no hay anuncio oficial. Durante estos días estaremos lanzando pequeñas pruebas con los inputs que los investigadores nos vayan facilitando.

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11 comentarios

Ygrámul -

Hurra!

Acabo de ver mi primera tarea de nanoluz acabar satisfactoriamente! Parece que todo le llega al que sabe esperar...

Ygrámul -

Hola de nuevo,

sí, en efecto, tengo permitidas las aplicaciones beta, pero tengo desmarcada la aplicación "nanoluz" en particular... Las beta van todas en el mismo saco, sean del proyecto que sean?

En relación a eso, desmarqué nanoluz al ver que sólo me llegaban tareas de esa aplicación y que todas fallaban al instante. Pensé que no se sacaría ninguna información útil de ello... ¿es así? ¿Recibís información útil para el "debug" de los errores de cálculo?

Deuvede -

El error se lo comento a su responsable, gracias por el feedback.

Ygramul, mira en tus preferencias, porque en la base de datos apareces como que permites beta.

Ygrámul -

Hola de nuevo,

y gracias al Califa por su recomendación. Como verás, he hecho buen uso de ella :-)

En fin, quería comentar que la aplicación nanoluz está dando algunos problemas:

- en primer lugar, a algunos se nos descargan tareas de nanoluz aunque la tengamos desmarcada en nuestras preferencias.

- eso no sería un grave problema si no fuera porque nos da error al cabo de más o menos tiempo de cálculo.

Mi máquina, en concreto, es de 64 bits, y como la aplicación está sólo disponible para 32, es posible que sea por eso. En cualquier caso, echadle una ojeada al servidor de tareas, que debe tener algún tornillo suelto ;-)

Gracias a todos!!

Califa -

Hola Ygrámul

Puedes postear las entradas del log en el foro que tenemos habilitado especialmente para ibercivis. Seguro que algún compañero puede resolver tus dudas: http://ibercivis.canalboinc.com


Un saludo.


Rafa Hens (El Califa)
www.canalboinc.com
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Ygrámul -

Y qué es la nueva aplicación "nanoluz"? ¿Tiene que ver con el proyecto de materiales?

Aparte de la curiosidad natural, también quiero comentaros que tengo un problema con esta nueva aplicación. Todos los "runs" fallan porque el BOINC no puede renormbrar cierto archivo de salida. ¿Tal vez un problema de permisos? Mis otros proyectos funcionan bien... Uso la versión 6.2.14 sobre Debian estable.

Si queréis puedo copiaros las entradas del log, pero en principio no he querido espamearos el blog... si hay un lugar más adecuado para esto, decídmelo.

Saludos,

ljfc2001 -

Estupendo, el proyecto va creciendo poco a poco.

Os interesa otro Raid??....cuando lo repetimos?? :-))

CSIC -

Hola foreros, teneis razón en querer saber qué nuevas aplicaciones se incorporan al proyecto.
Protomol 2.1 es una aplicación que simula las interactiones entre los átomos de las moleculas. Un investigador del CSIC empieza a usarlo ahora como beta de ibercivis para identificar los conformeros mas probables de dipeptidos y tripeptidos en la naturaleza (pues no se conoce debido a su reducido tamaño). Los cáculos masivos empezaran cuando la aplicación pase a producción.
Saludos!
Rubén Muñoz

markj -

poniendo ProtoMol Notre Dame en google se encuentra bastante información

Deuvede -

Tienes razón, perdona.

Se trata de un proyecto open source de la universidad de Notre Dame. Sé que estudia péptidos de proteínas, pero no sé mucho más.

Guiri-1 -

Buenas. Al menos podríamos saber de qué va ser la investigación, con qué campo está relacionada...
Gracias
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